hybrigenics - Y2H - PIMRider®

Y2H - PIMRider®

Outil de visualisation

PIMRider® est la plate-forme logicielle de protéomique fonctionnelle d’Hybrigenics, dédiée à l’exploration des cartes d’interactions entre protéines (PIM). Alimenté par nos données d’interactions, PIMRider permet l’exploration des fonctions biologiques et la compréhension des voies fonctionnelles.

Le PIMRider® intègre 4 outils de visualisation : pour plus de détails, sélectionnez le module sur le panneau droit, téléchargez la brochure ou visualisez notre démonstration « Flash ».
Le PIMRider® n’est pas inclus dans le service de criblage standard : veuillez nous contacter pour discuter des conditions d’accès.

Protein Viewer® - Visualiser rapidement les protéines et les annotations

> Moteur de recherche avancée : sélection du point d’entrée
     des protéines en utilisant divers filtres et mots clés
> Annotations fonctionnelles: description, alias, fonction,
     localisation, liens vers des bases de données bibliographiques
     et externes, séquence des protéines et informations génomiques
> Liste des protéines interactantes : chaque interaction se voit
     attribuer un score PBS®, qui est notre score de confiance exclusif.

PIM Viewer® - Parcourir le réseau d’interactions

> Affichage graphique des cartes d’interactions (PIM):
     différentes représentations de graphes, fonction
     d’affichage/masquage des protéines et fonction
     de recherche de chemin dans un graphe.
> Affichage simultané de plusieurs cartes d’interactions:
     pour la protéomique comparative
> Options de filtrage : par PBS, protéome, banque,
     localisation subcellulaire.
> Fonction import/export: sauvegarde, chargement
     et option d’impression de graphe.

Interaction Viewer® - Examiner le détail des données expérimentales

> Définition du domaine appât : position relative dans la protéine appât
> Liste détaillée des fragments proies sélectionnés : positions,
identifiants de clones, séquences 3’ et 5’ théoriques et expérimentales.
> Définition du SID® : zone d’interaction commune
à tous les fragments proies sélectionnés.

Domain Viewer® - Comparer les domaines fonctionnels et d’interaction

> Cartographie des domaines : vue graphique des domaines
     expérimentaux d’interaction (appât et SID), des domaines
     structuraux (peptides signaux, segments transmembranaires,
     régions «coiled-coil», structures secondaires)
     et des domaines fonctionnels (InterPro)
> Options de filtrage : par PBS, type de domaine ou PIM
> Options de tri : par PBS, nom de protéine ou taille de protéine.

PIMRider® viewers :

  > Protein Viewer®
  > PIM Viewer®
  > Interaction Viewer®
  > Domain Viewer®

> Télécharger notre documentation

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